延期一天

昨天晚上我跟闺蜜打电话时觉得好遗憾，本来是要一起玩的，俩人的行程也就差一天，还可以一起玩至少两个整天的，现在竟然面都要见不到了。电话里我表示要是能延一天回家就好了，这样我们28晚上就能见面了。坐在旁边的帅哥还比较配合，立马就跟Costco Travel联系，看看延期一天的可能性。

Costco Travel的工作人员也很忙，表示稍后打回来。等我们上床休息时也没收到回音。

今天早上帅哥才收到信息，租车倒是帮我们达成了新协议，旅馆比较难办。Costco Travel让我们自己去跟旅馆协商，帅哥去前台问了一下，旅馆竟然要400多块钱一晚上。他就趁我们等早餐的时机又回到房间拿出laptop到网上查询，定了对面的旅馆，才150一天，便宜多了，反正就是睡一晚的问题，设施没那么好也没问题。

这些旅馆也就是趁着旅游旺季涨价，平时淡季的时候，可能几十块就能住进去。

Indian Canyons的外星云

今天跟几家朋友一起去了Indian Canyons，这里有好几条trail可走，有平坦容易的，有稍微有些坡度的，有爬山顶的高难度的。

我们先选了个容易的试试水，由选了一个1.2迈的绿色的：

如何选择了个综合难度的、据说风景也好的：

地图上看不大明白，绿色的那段其实是在谷底，黄色的那段是翻山越岭，不过坡度不高，小路铺的比较平坦，只有一小段离悬崖比较近，所以走起来不是很困难。

这里的停车场比较大，还有售货亭可以买吃的喝的，还有小礼物，在地图上，这地方叫Trading Post。

这一天除了这里有特色的沙漠地貌：

大山都是像一层层的断石垒砌起来的，植物都是那种穿了裙子的大芭蕉扇。

我们今天有个特殊的经历，那就是一整天都觉得被各种UFO包围了。

给大家看看我们经历过的“UFO”：

这是Trading Post门口的金属艺术品：

远处天空里的白云就像龙骨：

Post门口的蜂鸟笼吸引了大批的蜂鸟驻足：

空中梯田：

哪怕是不像UFO，这云彩也很有特色，一团一团组装起来的：

像是从山中升腾起来的：

哪怕是离开了Indian Canyons，UFO云彩依然跟着：

大有一种龙卷风来袭的架势：

晚饭时间了，翠花，上盘子：

我本来以为这些UFO云是这里的特色，谁知两天后朋友们再去此处的时候，就没有这份幸运了，他们一朵UFO云也没看到。

MIT的最新基因编辑技术

前两天就看到MIT自己发表在校园网上的这篇报道了，没时间吐槽。

【新的基于 CRISPR 的工具可在细胞中的所需位点插入大 DNA 序列

该技术被称为 PASTE，具有治疗由缺陷基因引起的多种疾病的潜力。

安妮·特拉夫顿 | 麻省理工学院新闻办公室

发布日期:2022 年 11 月 24 日

在 CRISPR 基因编辑系统的基础上，麻省理工学院的研究人员设计了一种新工具，可以以更安全、更有效的方式剪掉有缺陷的基因并用新基因替换它们。

使用这个系统，研究人员表明他们可以将长达 36,000 个 DNA 碱基对的基因传递给几种类型的人类细胞，以及小鼠的肝细胞。这种被称为 PASTE 的新技术有望治疗由具有大量突变的缺陷基因引起的疾病，例如囊性纤维化。

麻省理工学院麦戈文脑研究所的麦戈文研究员 Omar Abudayyeh 说：“这是一种新的遗传方法，可以潜在地针对这些真正难以治疗的疾病。” “我们希望朝着基因疗法最初应该做的方向努力，即取代基因，而不仅仅是纠正个体突变。”

这种新工具结合了 CRISPR-Cas9 的精确定位，CRISPR-Cas9 是一组最初源自细菌防御系统的分子，与称为整合酶的酶结合在一起，病毒使用这种酶将自己的遗传物质插入细菌基因组。

“就像 CRISPR 一样，这些整合酶来自细菌和感染它们的病毒之间的持续斗争，”麦戈文研究员乔纳森·古腾伯格 (Jonathan Gootenberg) 说。“它说明了我们如何能够不断从这些自然系统中找到大量有趣且有用的新工具。”

Gootenberg 和 Abudayyeh 是这项新研究的资深作者，该研究今天发表在Nature Biotechnology上。该研究的主要作者是麻省理工学院技术助理 Matthew Yarnall 和 Rohan Krajeski、前麻省理工学院研究生 Eleonora Ioannidi 和麻省理工学院研究生 Cian Schmitt-Ulms。

DNA插入

CRISPR-Cas9 基因编辑系统由一种称为 Cas9 的 DNA 切割酶和一条短 RNA 链组成，后者将酶引导至基因组的特定区域，指导 Cas9 在何处进行切割。当 Cas9 和靶向疾病基因的指导 RNA 被输送到细胞中时，基因组中会产生特定的切口，细胞的 DNA 修复过程会将切口粘合在一起，通常会删除基因组的一小部分。

如果还提供了 DNA 模板，细胞可以在修复过程中将正确的副本整合到它们的基因组中。然而，这个过程需要细胞在其 DNA 中进行双链断裂，这可能会导致对细胞有害的染色体缺失或重排。另一个限制是它只适用于分裂的细胞，因为非分裂细胞没有活跃的 DNA 修复过程。

麻省理工学院的团队想要开发一种工具，可以切除有缺陷的基因并用新基因替换它，而不会引起任何双链 DNA 断裂。为了实现这一目标，他们求助于称为整合酶的酶家族，称为噬菌体的病毒利用这些酶将自身插入细菌基因组。

在这项研究中，研究人员专注于丝氨酸整合酶，它可以插入大块 DNA，大至 50,000 个碱基对。这些酶以称为附着位点的特定基因组序列为目标，这些序列起到“着陆垫”的作用。当他们在宿主基因组中找到正确的着陆点时，他们就会与之结合并整合他们的 DNA 有效载荷。

在过去的工作中，科学家们发现开发这些用于人类治疗的酶具有挑战性，因为着陆垫非常特殊，而且很难重新编程整合酶以靶向其他位点。麻省理工学院的团队意识到，将这些酶与插入正确着陆点的 CRISPR-Cas9 系统相结合，可以轻松地对强大的插入系统进行重新编程。

新工具 PASTE（通过位点特异性靶向元素进行可编程添加）包括一种 Cas9 酶，它在特定基因组位点进行切割，由与该位点结合的 RNA 链引导。这使他们能够针对基因组中的任何位点插入着陆点，其中包含 46 个 DNA 碱基对。这种插入可以在不引入任何双链断裂的情况下完成，方法是首先通过融合逆转录酶添加一条 DNA 链，然后添加其互补链。

一旦结合了着陆点，整合酶就会出现并将其更大的 DNA 有效载荷插入到该位点的基因组中。 

“我们认为这是朝着实现可编程插入 DNA 的梦想迈出的一大步，”Gootenberg 说。“这是一种可以很容易地针对我们想要整合的站点和货物进行定制的技术。”

基因置换

在这项研究中，研究人员表明他们可以使用 PASTE 将基因插入多种类型的人类细胞，包括肝细胞、T 细胞和淋巴母细胞（未成熟​​的白细胞）。他们使用 13 种不同的有效载荷基因（包括一些可能具有治疗作用的基因）测试了递送系统，并能够将它们插入基因组的九个不同位置。

在这些细胞中，研究人员能够以 5% 到 60% 的成功率插入基因。这种方法还在基因整合位点产生了极少不需要的“插入缺失”（插入或缺失）。

“我们看到的插入缺失很少，而且因为我们没有制造双链断裂，所以您不必担心染色体重排或大规模染色体臂缺失，”Abudayyeh 说。

研究人员还证明，他们可以将基因插入小鼠的“人源化”肝脏中。这些小鼠的肝脏由大约 70% 的人类肝细胞组成，PASTE 成功地将新基因整合到大约 2.5% 的这些细胞中。

研究人员在这项研究中插入的 DNA 序列长达 36,000 个碱基对，但他们相信还可以使用更长的序列。一个人类基因的范围可以从几百到超过 200 万个碱基对，尽管出于治疗目的只需要使用蛋白质的编码序列，从而大大减少需要插入基因组的 DNA 片段的大小。

“针对特定地点进行大型基因组整合的能力对基础科学和生物技术研究都具有巨大价值。我预计，这个工具集将对研究界非常有利，”加州大学圣地亚哥分校生物工程教授 Prashant Mali 说，他没有参与这项研究。

研究人员现在正在进一步探索使用该工具作为替代有缺陷的囊性纤维化基因的可能方法的可能性。该技术还可用于治疗由缺陷基因引起的血液疾病，例如血友病和 G6PD 缺陷，或亨廷顿氏病，这是一种由具有过多基因重复的缺陷基因引起的神经系统疾病。

研究人员还在网上提供了他们的基因结构，供其他科学家使用。

“设计这些分子技术的一个奇妙之处在于，人们可以以我们可能没有想到或没有考虑过的方式构建、开发和应用它们，”Gootenberg 说。“成为这个新兴社区的一员真的很棒。”

该研究由瑞士国家科学基金会博士后流动奖学金、美国国立卫生研究院、麦戈文研究所神经技术项目、K. Lisa Yang 和 Hock E. Tan 神经科学分子治疗中心、G. Harold 和 Leila 资助Y. Mathers Charitable Foundation、麻省理工学院 John W. Jarve 科学创新种子基金、Impetus Grants、囊性纤维化基金会先锋基金、Google Ventures、Fast Grants、Harvey Family Foundation 和 McGovern Institute。】

以后会不会人类和其他物种间就会有大量的基因混合？将来会不会出现半人半兽的新物种？

对人类的基因改造会不会牵一发而动全身，造成人们意想不到的后果？

最近的一个Q帖子也在讨论DNA的改变：

很多灵性圈的人认为人的DNA里不仅有决定人的身体的信息，还包含了这人的灵魂生生世世的信息，所以在一定的情况下才能激发人们的潜能，才能发现自己前世的经历，DNA里更是包含了跟神之间的联系。所以，他们认为保护自己的DNA不被改造是非常重要的，而撒旦要做的就是切掉人们跟神之间的联系。

我从小就倾向于接受自己的不完美，觉得不完美才造就了今天的自己，我可不想因为只是改变一点点不完美而去做个DNA改造的实验品。